Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms