Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VdrP48281 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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VdrP48281 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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VdrP48281 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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