Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms