Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms