Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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