Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms