Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OatP29758 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OatP29758 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OatP29758 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OatP29758 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms