Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms