Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cxcl1P12850 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl1P12850 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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