Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P10404 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P10404 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms