Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06335 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06335 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06335 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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