Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms