Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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