Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BlmO88700 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BlmO88700 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BlmO88700 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BlmO88700 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BlmO88700 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms