Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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