Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms