Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrxO54751 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrxO54751 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms