Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptch2O35595 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptch2O35595 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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