Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh2d1bO35324 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sh2d1bO35324 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh2d1bO35324 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms