Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dctn1O08788 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dctn1O08788 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms