Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20877J3QPZ4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20877J3QPZ4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms