Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms