Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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