Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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