Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms