Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Taf4bG5E8Z2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Taf4bG5E8Z2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Taf4bG5E8Z2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Taf4bG5E8Z2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms