Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm340F6RGI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gm340F6RGI3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gm340F6RGI3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm340F6RGI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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