Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc146E9Q9F7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc146E9Q9F7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms