Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms