Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20425E9Q035 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20425E9Q035 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms