Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc8E9PWG2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms