Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms