Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf39A2RT81 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms