Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms