Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms