Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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