Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms