Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nfe2l3Q9WTM4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nfe2l3Q9WTM4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nfe2l3Q9WTM4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nfe2l3Q9WTM4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms