Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms