Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms