Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Limd1Q9QXD8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Limd1Q9QXD8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms