Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms