Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CubnQ9JLB4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CubnQ9JLB4 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms