Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms