Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms