Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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