Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms