Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms