Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms