Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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